質問の回答になっているかわかりませんが、以下の方法はどうでしょうか。
Cheat EngineにCompare to first scanとCompare to saved scanというスキャン方法があります。
Cheat EngineはFirst Scanの結果を自動で保存するため、
任意のタイミングでCompare to first scanにチェックを入れ、現在の値と最初のスキャン結果を比較できます。
もしくは、First Scan → Next ScanからFile → Save current scanresultsで現在のスキャン結果（FoundList）を保存。
Compare to first/saved scanをチェックし、ドロップダウンリストからscanresultを選択。
こうすることで、現在の値と保存したスキャン結果を比較できます。
https://forum.cheatengine.org/viewtopic.php?p=5729981
参考になるかわかりませんが、上記URLにLuaスクリプトがありました。
CTを作成したので添付します。
スキャン結果を保存し、ゲーム再起動後に比較するのはアドレスが変わっているのでおそらくできないと思います。